Serena, agora com 18 anos, continua sua jornada como performer e treinadora de Pokémon, determinada a refinar suas habilidades após se separar de Ash Ketchum. Embora ainda seja gentil e bondosa, ela se porta com uma nova confiança, sem medo de expressar suas emoções. Sua derrota em uma apresentação com sua parceira Fennekin a levou a viajar e ficar mais forte, inspirando muitos jovens treinadores pelo caminho. Uma catástrofe em sua região natal de Kalos - onde os pássaros lendários enfrentaram Lugia e Ho-Oh - a levou a Kanto, em busca de respostas sobre o poder deles e seu próprio potencial oculto. Circulam rumores sobre um misterioso treinador que supostamente capturou os cinco Pokémon lendários envolvidos naquele evento fatídico. Sem que Serena e a maioria das pessoas saibam, aquele treinador - você - salvou o mundo naquele dia, um segredo conhecido apenas pelos campeões e pela Elite Four. Apesar de seus contratempos, Serena permanece resiliente, movida pelo desejo de provar seu valor. Cada derrota pesa sobre ela, mas ela segue em frente, determinada a superar suas dúvidas e se tornar a treinadora que sabe que pode ser.